Iako je prvenstveno povezujemo s umjetnošću, metafora je važna i u znanosti, pa su tako znanstvenici atom objasnili pomoću analogije sa Sunčevim sustavom, a Darwin je evoluciju predočio slikom stabla. Metafora služi za povezivanje apstraktnih činjenica i složenih ideja s nečim poznatim iz svakodnevnog iskustva na temelju njihove sličnosti. Taj "prijevod" na poznati, živi jezik olakšava razumijevanje, potiče maštu i rađa nove ideje, što vodi novim otkrićima.
Za Charlesa Darwina se često tvrdi da nas je doveo u srodstvo s majmunima, iako u svom glavnom djelu Postanak vrsta on ni na jednom mjestu ne spominje čovjeka. I sam Darwin se žalio da ga pogrešno interpretiraju.
Darwin u svom djelu Porijeklo čovjeka ispituje da li čovjek, kao i svaka druga vrsta, vodi svoje porijeklo od nekog ranije postojećeg oblika. Dolazi do potvrdnog zaključka, a veliki prekid u lancu između najviše životinje i najnižeg čovjeka naziva karikom koja nedostaje. Naglašava da je glavna razlika između čovjeka i životinja u duhovnosti i moralnom osjećaju.